一、报告内容
中国是猕猴桃的起源地和分布中心，也是猕猴桃栽培面积和产量第一大国。高质量参考基因组的绘制对猕猴桃重要农艺性状的功能基因组学研究和全基因组分子设计育种具有重要理论意义和应用价值。使用HiFi、ONT和Hi-C测序数据，并结合自主开发的组装脚本，我们对猕猴桃基因组首次测序的材料——中华猕猴桃（Actinidia chinensis）进行了端粒至端粒（telomere-to-telomere，T2T）的从头组装，绘制了完全连续、没有缺口的单倍型高质量参考基因组Hongyang v4.0。T2T是一种最新的基因组绘制标准，要求每条染色体从一端端粒至另一端端粒中的所有复杂结构、高度重复序列等都能被完整组装，内部没有或仅有少数缺口。T2T基因组的组装不仅对端粒、着丝粒等高度重复序列的研究具有重要意义，而且能够获得基因组的完整遗传信息。通过梳理前期使用的脚步，我们开发了一款名为quarTeT的T2T基因组组装与端粒/着丝粒鉴定工具包，包含AssemblyMapper、GapFiller、TeloExplorer和CentroMiner四个子工具。其中，CentroMiner可以用于鉴定大多数具有重复序列结构特征的典型着丝粒。
二、主讲人
岳俊阳，安徽农业大学园艺学院。从事猕猴桃基因组学研究，围绕基因组结构变异在猕猴桃进化和物种分化中的作用机制开展工作，近年来整合基因组学揭示了猕猴桃性染色体的演化历程与进化动力，同时系统鉴定了基因组上的性别拮抗和有害突变位点，为猕猴桃杂交育种提供了新的理论指导。
三、时间
2024年9月27日上午9：30-11：00
四、直播链接
https://sahhb.xetlk.com/sl/3IyN5E
