为了提升生物信息分析在生物学研究中的应用能力，帮助pg电子娱乐平台下载师生尤其是研究生利用生物信息学技术更好地开展科学研究，生命科学学院将邀请英国詹姆斯霍顿研究所计算生物专家张润煊博士为pg电子娱乐平台下载师生开展3D RNA-seq培训课程，欢迎有兴趣的老师和研究生报名参加。
一、培训内容及安排：
3D RNA-seq – A flexible and powerful tool for differential expression and alternative splicing analysis of RNA-seq data for biologists
培训时间：10月9-10日
培训费用：免费
培训地点：生科楼E2004
培训学员：20人，报满为止：
Oct 9th,2024 | ||
9:00am-10:00am | Accurate and rapid transcript quantification using RNA-seq data | Runxuan Zhang |
10:00am-10:30am | Break |
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10:30am-11:30am | Genome-wide analysis of the transcriptome: transcript quantification using Salmon and Galaxy | Runxuan Zhang |
Oct 10th, 2024 | ||
9:00am-9:45am | Transcriptome data exploratory analysis: 3D RNA-seq App, Demo | Runxuan Zhang |
9:45am-10:00am | Break |
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10:00am-11:15am | 3D RNA-seq App hand-on session | Runxuan Zhang |
11:15am-11:30am | Break |
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11:30am-12:00am | One-to-one session (appointment required) | Runxuan Zhang |
主讲人：
张润烜教授：英国詹姆斯霍顿研究所计算生物专家（副教授级）
张润烜博士及其团队的研究重点在于高通量生物实验数据的前沿计算方法的创新和研发，尤其在应用高通量转录组（RNA-seq）来分析选择性剪切的领域，发表了一系列世界领先的数据处理方法和软件。2017以及2019年张润烜博士发表的高质量，高精度的转录组标准，使得选择性剪切的定量分析的精度得到大幅提高。同时创建高质量，高精度的转录组标准的方法，得到全球广泛的认可和采纳，与世界各地的植物研究中心也应用于包括大麦（英国，美国，德国）, 土豆（英国），西红柿（英国），生菜（英国，荷兰），大米(印度)，棕榈油（马来西亚）的经济作物中，同时，张润烜博士团队于2019年得到英国研究署40万英镑的资助完成自动生成高质量，高精度的转录组标准的软件和平台。同时2019年张润烜博士团队发表了一款用高通量转录组（RNA-seq）进行基因表达和选择性剪切全面并快速分析的软件（3D RNA-seq），该软件在2019年获得邓迪大学生命科学学院的最佳创新奖。 目前3D RNA-seq的用户超过16，000人遍布世界96个国家。该论文被的论文引用100次，其中的引用论文发表在包括《自然》，《自然通讯》，以及《植物细胞》等高影响力的杂志上；张润烜博士及团队应邀在英国利兹大学，约克大学，诺丁汉大学，澳大利亚国立大学，德国莱布尼茨植物遗传学和作物研究所等多地进行了3D RNA-seq讲座和培训。